Riset Baru Yakini Varian Omicron Berasal dari Tikus

Riset Baru Yakini Varian Omicron Berasal dari Tikus

Nafilah Sri Sagita K - detikHealth
Minggu, 09 Jan 2022 13:00 WIB
Riset Baru Yakini Varian Omicron Berasal dari Tikus
Ilmuwan yakini varian Omicron berasal dari tikus. (Foto: Thinkstock)
Jakarta -

Ilmuwan Afrika Selatan menjadi yang pertama mendeteksi varian Omicron, varian baru Corona B.1.1.529 yang disebut 500 persen lebih menular ketimbang varian asli. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) bahkan langsung memasukkan varian Omicron dalam daftar Variant of Concern atau varian mengkhawatirkan.

Awal Januari 2022, kasus Omicron meledak di banyak negara. Paling terlihat di Amerika Serikat dengan catatan 1 juta kasus COVID-19 per hari. Banyak mutasi di varian Omicron yang diidentifikasi pakar kesehatan jarang terjadi di antara varian virus yang di-sequence sebelumnya.

Ini adalah teka-teki bagi para ilmuwan karena tidak ada varian perantara yang diketahui untuk mengungkapkan bagaimana Omicron berevolusi. Ini hampir seolah-olah seperti varian baru muncul entah dari mana.

ADVERTISEMENT

SCROLL TO CONTINUE WITH CONTENT

Ada tiga teori alternatif asal usul Omicron, dikutip dari Medical News Today:

1. Varian ini berevolusi tanpa terdeteksi dalam populasi di suatu tempat, di dunia, di mana ada sedikit pengawasan sequencing virus COVID-19.

ADVERTISEMENT

2. Berkembang pada seseorang yang terinfeksi COVID-19 dalam waktu yang sangat lama karena mengidap gangguan imunitas tubuh, mungkin sebagai akibat dari infeksi HIV bersamaan atau pengobatan dengan obat penekan kekebalan.

3. Ini berevolusi dalam populasi hewan sebelum manusia terpapar virus.

Teori kedua menjadi yang paling populer di kalangan ahli virus dan ahli epidemiologi. Namun, beberapa ahli berpendapat bahwa virus lain, seperti virus influenza, cenderung menjadi kurang menular dari waktu ke waktu pada individu dengan sistem kekebalan yang terganggu.

Mereka mengutip bukti bahwa sementara virus tersebut mengembangkan adaptasi terhadap sistem kekebalan inang mereka, mereka mengakumulasi mutasi lain yang membuat mereka kurang mampu menyebabkan infeksi pada orang lain. Namun, Omicron tampaknya lebih menular daripada semua varian yang diketahui sebelumnya.

Berasal dari tikus?

Para peneliti di Akademi Ilmu Pengetahuan China di Beijing kini telah menemukan bukti bahwa Omicron mungkin telah mengembangkan kumpulan besar mutasi yang tidak biasa pada tikus.

Mereka percaya bahwa varian sebelumnya, dari garis keturunan yang dikenal sebagai B.1.1, melompat dari manusia ke tikus pada pertengahan 2020. Seiring waktu, ia mengembangkan berbagai adaptasi ke inang barunya sebelum menyebabkan infeksi pada manusia di akhir 2021.

Mereka mengidentifikasi 45 'mutasi titik' dalam RNA Omicron yang mereka usulkan terjadi setelah varian berpisah dari nenek moyang terakhir yang diketahui pada manusia. Mutasi titik adalah substitusi dari huruf kimia tunggal, yang dikenal sebagai basa, dalam kode genetik empat huruf.

Penelitian sebelumnya menunjukkan virus RNA cenderung mengambil lebih banyak mutasi pada basis tertentu, sesuai dengan inang hewan mana mereka bereplikasi di dalamnya.

Dengan menggunakan pengetahuan ini, penulis sebelumnya telah mengidentifikasi 'tanda tangan' mutasi dari inang hewan SARS-CoV-2 yang berbeda. Studi baru mereka menemukan bahwa frekuensi relatif dari mutasi titik baru di Omicron cenderung menjadi karakteristik evolusi pada inang tikus daripada inang manusia.

Mereka menemukan bahwa tanda mutasi Omicron berbeda dari beberapa varian yang diketahui telah berevolusi pada manusia, termasuk tiga varian yang diisolasi dari pasien dengan COVID-19 kronis.

Para ilmuwan juga menemukan bahwa beberapa mutasi pada spike protein Omicron, yang digunakan SARS-CoV-2 untuk menyebabkan infeksi pada sel inang, membantu virus mengikat lebih erat ke reseptor targetnya pada tikus.

Mereka telah mempublikasikan temuan mereka di Journal of Genetics and Genomics.




(naf/naf)

Berita Terkait